磁悬浮列车还有一大缺点,就是它不能变轨,它只能在同一轨道上在起点和终点之间折返运行,而不像轨道列车可以通过岔道换轨到另一轨道上。假如修建一条从济南到章丘的磁悬浮轻轨,磁悬浮列车从济南出发到达章丘后,再折回济南,这样在整个这条线路上只能有一列磁悬浮运行。假设运行线路长50公里,中途设立10个小站,每站停车1分钟,采用中低速磁悬浮的最高时速为100公里,启动和靠站的低速运行时间滞后1分钟,从济南到章丘需要50分钟,按每天运行14小时,每天往返8次,若每车载客500人计算,一天的载客量仅为8000人次,相当于200辆40座公共汽车的载客量,一条车流量能够达到14辆/小时的村级公路即可完成相同的运量。即使按照40元的票价,该磁悬浮列车的满客年收入约为1.2亿元,(上海磁悬浮售票收入约2亿元),而前期投资为140亿(50′2.8),贷款年利息7亿元(140′5%),还未考虑运行成本,人工工资,设备折旧与维修费用,年亏损5.8亿元。修建双线的话,投资为280亿元,年亏损为11.6亿元,可见线路越长,亏损越严重,即使只考虑与贷款利息持平,票价需定为230元,相当于济南到青岛动车票价的2倍!考虑30年收回成本,每年运行成本1亿元,则票价应为400元,相当于济南到北京的飞机票全价,再考虑高昂的维修成本,票价会更高。
因此磁悬浮专家王梦恕院士在接受《科学时报》专访时说:磁悬浮列车不具备“安全、可靠、适用、经济”四项指标的严格要求,只能在特定的地区,作为一种“交通玩具”,起到技术展示的功能,而且是一种费用高昂的“交通玩具”。