正交反交都可以得到三倍体种子是肯定的。这个问题我曾经查阅大量资料没有找到答案。一般的说法类似你问题中所问的:胚珠硬化,种子发育比较困难,形成的三倍体种子难于萌发,且果实品质差。
说一些个人看法:如果用二倍体作父本四倍体作母本,则三倍体西瓜的细胞质基因来自四倍体;反过来,如果用四倍体作父本二倍体作母本,则三倍体西瓜的细胞质基因来自二倍体。这是这二者的本质区别。细胞质基因来自二倍体的三倍体西瓜,其珠被和正常西瓜一样能发育成种皮,那么得到的就不是无籽西瓜了。反过来细胞质基因来自四倍体的三倍体西瓜,具有多倍体的特点——发育迟缓,在珠被还没有发育成种皮就被人食用。
这些是我自己的推测未得到权威机构或人士认可,如有错误敬请指出。