影响西红柿苗木培育的环境因素很多，但主要的因素是光照、温度、湿度、水份和风速，建立设施的目的是改善和控制这些环境因素。如网室的建立能使直射光改变为漫射光，室内的温度略有升高，湿度增大，蒸腾量下降，风速明显减弱。温室大棚则使温度、湿度明显提高，形成无风和蒸腾量极低的环境。高温和干旱的季节进行喷灌能快速均匀地满足苗木对水份的需求而加速苗木的生长。人工影响环境的方式方法多种多样，基本的目标是确保西红柿苗木可终年生长，可终年进行移栽、嫁接、出圃等作业，育苗的时间比传统的育苗方式大大缩短。
基质是西红柿种苗扎根和生长的依托，工厂化育苗必须人工配制适合西红柿健康生长的全营养基质。基质要求营养丰富，既透水透气，又保水保肥，且质地较轻。在人工设施苗床的基质中移植苗木能实现“零死亡”，幼苗在基质中生长较快，苗木达到出圃标准后通过肥水制约又能控制其过快生长，能做到促控自由。

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