具体来说，有以下几个方面的原因：
1.史书记载太混乱
关于这个时期的战争，各项记载都十分夸张失实，并且各项文献还经常自相矛盾。
“白袍将军”陈庆之的相关记载就很能说明问题了。陈庆之一生的主要战绩，就是数千军队纵横北国，据记载：

徐州之战他率2000军防守，对北魏2万，大胜；涡阳之战，先是率200人突袭北魏15万军队的先锋，奔袭数十里，大败之。逼得北魏军前进停滞。胶着一年后，梁帅欲退兵（此时陈庆之是副将），陈冲进营帐逼宫，取得指挥权后率全军（仍是数千）突袭，连破十三道营垒。魏军全溃，书称“尸首淤塞淮水”；北伐洛阳之战，陈庆之率七千白袍，大战四十七，全胜！攻城三十二，皆克！取帝都，卷半国！ 最后若非天灾，还要全身而退。北方民谣称：名军大将莫自牢，千军万马避白袍。

陈庆之这样近乎已经到传说级别的传奇记载并不是孤例。其他诸如冉闵、陈霸先、慕容儁等人的传记里也经常出现这样夸张的战例。
中国古代的史学家有时候就是这样，夸张起来超过小说家，春秋笔法起来天书都没他简略。

2. 时间跨度太长，王朝关系错综复杂
史家为了记述方便，一般写作两晋南北朝，还具体到建国、亡国时间，让人感觉是分的很清楚的，其实从五胡乱华拉开乱世的序幕开始，之后的历史发展一直错综复杂，并且相对连贯，各家血缘、师生、上下属，各种关系千丝万连，时间跨度极长，人物羁绊极深，随便漏掉一个重要人物不讲，一次重要战争带过，后面的各种恩怨情仇、家国设定就很难理解了。一般人光记住鲜卑匈奴羯氐羌就犯难了，你还要提前后赵、前后西秦、前后西北南凉、前后南北西燕、冉魏、北魏、东西魏、北周北齐宋梁陈。这不是要了老命了么？！（顺便说一句就算同用一个国号，国君也不一定有关系，比如前后西北南凉就是由三个不同的民族建立的政权，前后赵也分别是由匈奴和羯建立的）
所以说，能怪历史书把这段历史略过去嘛？不略过去你打算拿几本书讲这一段？

3. 相关文艺作品缺乏
按道理说，就算记载失实，关系复杂。史书不好读，要写小说却没影响（甚至记载夸张、关系复杂还对文学创作有好处）。这段历史最吸引人的就是英雄枭雄层出不穷！从上至下，前有苻坚、冉闵、慕容儁，中间慕容垂、拓跋珪、拓跋宏，双雄高欢、宇文泰，南边刘裕、陈庆之、陈霸先，这些是巨星。其他的就是尔朱荣、候景不算，谢安谢玄桓温郗超也能凑个数嘛。

可问题来了，不得不承认的是，这三百年乱世间的英雄，却大部分活跃在北方战场。其中大部分又都是胡人。这三百年，是汉族五千年来最黑暗的三百年，没有之一。就算后来宋元清也不及这三百年的惨状。北方的故园，就是汉人的地狱，各种被屠杀，被奴役。南方的汉人偏安一隅，苟延残喘。三百年前所未有的长夜是所有汉族知识分子都不愿回首的。小说家，戏曲家也都是汉人。写个《三国演义》都要自发维护正统，贬低逆臣。更何况肆虐北方，在他们眼中如同**一般的胡人？然而要写这段，就避不开北方雄才大略的这些英雄枭雄们。汉人英雄又大多悲壮，不是偏安一隅，就是爆发一时，迅速陨落。悲壮不已。怎么写？
不如不写。

就因为以上的这种种原因，对于这段历史，官方研究困难重重。民间创作又进退两难。所以才造成了现在这样冷门的结果。
不过我相信仍然还是有许多人热爱这段历史的，毕竟就算剔除史书夸张的成分，这段历史仍然是如此的波澜壮阔，遍地热血；英雄辈出，灿若星河。