白组的 CG 工作主要从建模起步，Picture Element 那儿有三维激光扫描系统，扫描出来的数据传给白组，白组再根据这个数据进行建模，因为扫出来的只是外形，外观上还需要手动添加细节。井上曾把加上了细节的建模提交给庵野，不过庵野不太喜欢这种 " 半成品 "，回了句，" 您不如先把雏形给我得了，这种半成品和雏形基本没两样。"
本次最大的难点反而是在追求真实性的 CG 上要求哥吉拉【要有皮套的质感】，而且庵野总监督特别强调了这点不可怠慢。最初在井上看来，哥吉拉就是生物，还【特别为其准备了筋骨的动作】，全给庵野否定了。庵野告诉他，【哥吉拉不是什么巨大爬虫类不是恐龙】，这点要特别注意。以竹谷隆之做好的雏形为标准，骨骼大体上按照哥吉拉的形状，但各关节的动作实际上更接近人，就好像其实是人在里面一样。这是庵野的 " 至高命令 "。
在他们内部把竹谷隆之做好的那尊雏形叫做 " 本尊 "，一切细节以它为标准。皮套质感也是庵野对初代哥吉拉特别致敬的一点，因为初代哥吉拉是橡胶皮套，新 · 哥吉拉也被要求用 CG 还原橡胶的质感。除了这点外，背脊的部分也是庵野特别纠结的地方。初代哥吉拉背脊的部分，有一部分是会动的，有一部分是不动的，这点也是新 · 哥吉拉继承初代哥吉拉的地方。建模的过程中会做某种程度上的动作模拟，再进行调整。
特别让在《超凡蜘蛛侠》等好莱坞大片中负责CG的动画师佐藤笃史负责了哥吉拉的动作监修，他在仅回日本的3个月间几乎被关在白组。在片尾的职员表上虽然是以监修的名义，但动作几乎是自己加的，回到温哥华后他也在做着这边的工作。负责CG动画方面还有一位熊本周平，他也不是白组的人。熊本的职位是“哥吉拉概念动画师”，主要负责的是统一哥吉拉的演技和动作的方向性。除了佐藤笃史和熊本周平，其余哥吉拉的CG动作全包给另一家名为“神央药品”的CG动画公司，哥吉拉之外的战车、直升机的CG则全部由白组自家制作。
关于哥吉拉的动作，庵野的要求同样是“总之不是生物就对了”，于是这次就没多此一举加上动作模拟。佐藤笃史因为是在好莱坞做CG的人，起初说到哥吉拉联想到的是2014年在全球上映、由加雷斯·爱德华执导的《哥斯拉》（美版），不过某种意义上，这和庵野秀明的理念是相反的。庵野的这套理念对井上浩正来说就像海啸一般冲击，不过更辛苦的还是庵野，这次集合了大量的演职人员，他的这套想法几乎要灌输到每个人的脑中。
井上和佐藤敦纪同样提到预告片开场前6秒中哥吉拉吼叫的画面，井上说到，预告片刚公开的时候就是希望给人留下印象，这是庵野的哥吉拉所给人的皮套感。一般CG检查的时候，庵野都会跟他说到，“保持真实感就好”，而到了哥吉拉这儿一定要有皮套感才能过关。刚开始井上也是一头雾水，庵野想要的哥吉拉并不是那种怀古趣味那么简单，这点他能理解，即使到完成之后，井上还是很难参透庵野的感觉。在制作过程中只能努力去跟着庵野的感觉走，顺着庵野的思考方向来。虽然没法完全理解，但跟着庵野的这段时间内还是学到了不少。