以往有外科手术拨甲、口服药物治疗等方法。手术拔甲损伤大容易继发感染，口服药物毒副作用太大，这两种方法现在多不采用。灰指甲专家建议根除灰指甲多采用外用药物法。
外用疗法较安全，一般无痛苦、无副作用，外用涂抹能够直达病灶，作用患处。根据药剂不同，主要有浸泡、局部涂药和封包削治等方法。