最重要的是我希望可以见到不同于暗影狂奔的融合

你参考下战锤40K呗，世界发展不均衡，技术断层，科学也被发展成为一种宗教。
你大可以设定，因为生存环境不一，每个世界的技术风俗不一，所以信仰不同完全可以理解。

暗影狂奔其实很独特，因为它有Astral Space这个设定，可以说属于科幻奇幻杂糅，所以它的宗教设定事实上很“传统”——因为那些超自然事物是真实存在的，这就和一般的奇幻小说差不多，处理手法也就接近。
所以你要看你的设定是什么样的，是类似暗影这样有大幅传统奇幻设定的，还是更偏向传统的科幻赛朋？前者的话你不想“简单融合”就要减小超自然力量的实际干涉，不然每天都有Baba Yaga蹦出来你很难不采用传统奇幻的处理方式，比如猎魔人什么的，毕竟一般来说只有替身才能——我是说只有魔法才能对抗魔法。
而更科幻一点的设定其实也有很多现成的灵感，像DOOM里人类在火星制造的机械恶魔、战锤40k里的机魂等等，都很有参考价值。
科幻些的赛朋设定一般是在“宗教”和“崇拜”本身上做文章，将其解构或者还原本义，这种思路下的“宗教信仰”更像是对某种理念的坚持，宗教斗争也更像科学、哲学观点或者发展方向的对抗。举几个我一下能想到的点子（有些已经有作品使用了）：崇拜万联网（这个词指赛朋设定里常见的“万能基础网络”）的宗教啊、认为肉体弱小所以痴迷义体/人体改造/电子飞升的宗教啊、认为人类有造物才能并加以崇拜，因而认同机器人智慧/灵魂的宗教（以及否认这种观念的宗教）啊等等……
当然你既然说“多神教”，单纯有理念还不够，背后要有能够支撑的超自然力量，但这些元素需要用赛朋的方式加以改造。
比如学习能力有缺陷导致被恶意侵染的电子意识（电子恶魔）及其相对的“善意天网”（人造AI或者人脑连接）、能够同时感染机械和肉体的病毒、基因变异导致神经信号可以直接与电子语言交互的人群、全身义体的先知、通过神秘黑客手段控制教众的邪教、拥有来源不明的先进科技，克苏鲁风的超级公司……
我能想到的思路大概是这样，楼主可以做个参考。

dnd的奥伯伦世设就有点这个意思

多神教是什么五火球神教里有个它叫不叫多神教