区块链有很多的优点，不然也不会被炒的这么火，但是，区块链的缺点也不少，这些都是技术难题。
1、区块链的成本
不受任何一方控制的不可变的审计跟踪记录当然有用，但创建这样一个系统却面临很多的成本。不妨分析其中一些问题。
2、开发更严格、更缓慢
建一个可证明一致性的系统并非易事。一个小错误可能会破坏整个数据库或导致一些数据库与其他数据库不同。当然，损坏或拆分的数据库不再有任何一致性方面的保证。此外，所有这类系统一开始设计时就确保一致性。区块链中没有“快速行动，打破陈规”（move fast and break things）一说。如果你打破了陈规，就丧失了一致性，区块链就会损坏，毫无价值。
3、奖励结构很难设计
增设正确的激励结构，并确保系统中的所有参与者无法滥用或破坏数据库，这同样是需要考虑的一个重大因素。区块链可能是一致的，但如果由于往里面添加数据的成本很低，因而区块链里面有大量无关紧要的无用数据，区块链不是很有用。但如果由于往里面添加数据的成本很高，因而区块链几乎没有什么数据，那么一致的区块链也没有用。
4、维护成本非常高
传统的集中式数据库只需要写入一次，区块链需要写入数千次。传统的集中式数据库只需要核查一次数据，区块链需要核查数千次数据。传统的集中式数据库只需要传输一次数据以便存储，区块链需要传输数千次数据。
维护区块链的成本要高出几个数量级，需要由实际功效来证明成本。如果充分利用完整性检查、收据和备份，寻求上述一些属性（比如一致性和可靠性）的大多数应用就能如愿获得这类属性，而成本低得多。