1、柳州
我从知乎上搜到说"柳州以综合交通工程为名修了火车站的三站两区间。"然后查了下百度百科：
建设进展2015年9月2日，市委常委会听取了市发改委（市轨道办）对城市轨道交通前期工作情况汇报。原则同意启动我市的城市轨道交通建设。
2015年11月15日—17日，柳州市城市轨道交通线网规划专家评审会原则通过线网规划。
2015年11月24日，市发改委和市规划局按照国家政策要求对线网规划进行了公示。经公示后的线网规划上报自治区住建厅，于12月31日由自治区住建厅组织技术审查并原则通过。柳州城市轨道交通规划建议采用悬挂式单轨。
2016年2月26日召开市委常委会，听取我市城市轨道交通工作情况的汇报。年内开建轨道交通1号线，制式为跨座式单轨。已开展轨道交通试验工程的项目建设书，可行性研究和初步设计等前期预备工作。
2016年12月1日，1号线试验段开工仪式在火车站东广场正式启动，线路采用地下+高架跨坐式单轨列车模式运行，标志着柳州轨道交通正式步入建设阶段。

据广西壮族自治区发改委官网在线资讯栏目显示，一位名为“轨道城市”的网友询问：您好，2017年柳州市城市轨道交通规划已通过国家环保部的审批，请问自治区发改委已经把柳州市城市轨道交通规划可研报告上报国家发改委了吗，大概还有多久能够批复？
发改委回复如下：
尊敬的网友： 您好！关于您咨询的有关柳州轨道交通的相关问题，经研究，答复如下： 根据国家相关规定，开展城市轨道交通建设的城市，需按程序先后编制城市轨道交通线网规划和建设规划。线网规划需纳入城市总体规划，并由住建部对城市总体规划及线网规划一并审批。目前柳州市城市轨道交通线网规划尚未通过住建部审批，不具备向国家发展改革委报批建设规划的条件。
【很明确、没有得到发改委审批】

然后我从柳州贴吧看到的消息是 属于违建、但是一直在建，2020通车。

http://tieba.baidu.com/p/6395871691?pid=129249862177&cid=0#129249862177 柳州轻轨的建设进度。

其它没经过国家发改委批准的还有：
杭州以地下综合工程为名私建了几十公里；
深圳地铁20号线，以国际会展中心配套工程的名义在建。
以上是我从知乎搜到的原话，改天有空时详细查一下。也希望懂得人补充。

大连地铁12号线，以有轨电车202路延长线的名义报批的，然后修成了4B地铁

咱的3号线高新区至南站不就是这么干的么，2015年批下来的时候，线路都通车2年了