1、申请的机构不同
商标是通过商标局进行申请。版权是通过中国版权保护中心进行登记申请的。
2、保护对象不同
商标权保护的是经过国家商标管理机关核准注册的商标。
版权保护的是中国版权保护中心登记的作品，而根据《中华人民共和国著作权法》的规定是以作品的完成为著作权产生的标志而不是发表时。
3、保护的期限不同
商标的期限为10年，超过了10年需要申请续展。版权的受保护期限为作者终生及死后50年。
一些申请人认为拥有了商标的商标权等同于拥有了商标的版权。但事实并非如此，以上区别就可以看出。如果想要同时拥有商标的商标权和版权，在注册商标时，最好做版权登记。
1、商标是按类别申请注册的，对商标的保护也是按类别。如果您的商标还没做全类保护，那登记版权就能起到很好的辅助保护作用。
2、商标申请周期较长，版权申请周期短。在商标核准注册前，版权证书可以起到一定的商标防御作用。
3、版权可以证明商标的归属权。做好版权登记可以为日后遭遇商标纠纷提前准备好证据。
4、版权一旦登记后，其他人若想使用商标，必须经过权利人的允许，否则都属于侵权。版权登记证书可作为权利证明，是著作权人启动反盗版维权行动的前提条件。