港澳通行证的签注一般是6个月，也就是半年。大陆公民凭借港澳通行证到港澳地区，超出旅居滞留限制的要求，就必须进行签注。每次有效签注期限为6个月，行前应先到边境检查站办理。此外，还有另一种非正式的形式，在前往港澳地区的航班飞行前的一定时间，搭乘航空公司可以申请航班签注，有效期一般为当天及第二天，但本次旅行后，如果还要前往港澳地区，不便再次申请航班签注，就必须办理正式港澳通行证的签注手续了。