民办学校的学费可以由政府补贴、自营性收入和学费三部分组成。政府补贴一般在补助教学、教学研究、设备投入方面下达；自营性收入来源于民办学校本身的收入，包括企事业的投资收入、服务收入等；学费则是最主要的收入来源，也是民办学校收费的基本来源。学费的主要目的是弥补民办学校的财力不足，支付学校的教育支出、设施投入、科学研究等。