目前，巴中恩阳机场共有45家航空公司在该机场营运，包括各大国内航空公司以及一些国际航空公司。其中包括国家航空公司、中国南方航空、国泰航空、东方航空、海南航空、九元航空、首都航空、厦门航空等，和不少国际航空公司，如荷兰皇家航空、瑞丽航空、星空航空等国际航空公司。综上所述，巴中恩阳机场现有45家航司在执飞，该机场的航司结构非常多元化，既有国内航司，也有国际航司，能够满足不同乘客出行需求。