中国医科大学目前有三个校区，分别是位于辽宁省沈阳市的沈阳校区、位于江苏省南京市的南京校区和位于四川省成都市的成都校区。其中沈阳校区是中国医科大学的主校区，南京校区是中国医科大学临床医学院的所在地，成都校区是中国医科大学基础医学院的所在地。这三个校区都拥有自己的教学楼、实验室、医院、图书馆、学生公寓以及各类配套设施。