这个问题的答案不能单一，因为两所大学都是中国优秀的高校，他们都有各自的优势。南京大学是中国历史最悠久和最著名的学府之一，具有悠久的历史和传统；苏州大学在新兴专业方面发展得很快，在中国大陆的科研水平上位列前茅，特别在工业设计、机械工程与计算机科学等方面更有优势。最终，选择哪所大学更好，要根据个人偏好和发展目标来决定。