火影忍者手游主线副本一共有17章。目前有剧情的章节只有冒险副本，分别是漩涡鸣人登场之章、再不斩与白之章、中忍考试之章、鸣人大战我爱罗之章、寻找纲手之章、终结之谷之章、风影营救之章、佐助突破之章、宇智波真相之章、自来也潜入之章、木叶崩坏之章、五影会谈之章、九尾之乱之章、忍界大战之章。