在红色警戒末日危机第二关，可以建造潜艇并点选它们来进行攻击。同时使用指挥船时需要按住Ctrl键再用鼠标点选指挥船。苏联维拉迪摩阵营的战舰可以使用舰载弹道导弹攻击，这可能会对过关有所帮助。