对于目前质疑进化论的声音，无外乎几种。
第一：如果人是由猴子变的，为什么现在的猴子没有变成人？
第二：如果人是进化来的，为什么地球上就只有人类一种智慧生物？
第三：化石的断层，是不是说明进化论从一开始就是错的？
要说进化论到底靠不靠谱，我们得先说一说进化论到底是什么东西。以下我说的进化论指的是现代综合进化论，而不是达尔文的进化论。
这两者有什么区别呢？现代综合进化论和达尔文进化论的基本观点是一致的，也就是物竞天择，适者生存，但是现代综合进化论得回答达尔文进化论没办法回答的一个问题：生物为什么会进化？
忽略掉漫长的进化时间，先从微观到宏观梳理一下进化的过程。
任何一种生物，其基因在诱变因子的作用下都会发生突变，基因突变是进化的原材料，也是生物为什么会进化的原因。
基因突变可以在任何时间任何地点、任何生物的身上发生，发生的概率极低，突变的方向不确定，突变形成的基因多害少利。
而就是那极少的“利”成了进化的动力。另外，只有生殖细胞的基因突变可遗传给后代，而体细胞的基因突变通常会成为癌变。
可遗传基因突变就会导致亲代基因和子代基因并不会百分之百相同。这种差异很微小，但是经过无数代的积累后，其差异就会变得极大，量产引发质变，最终成为另外一个物种。
也就是说，进化只发生在迭代的时候，这也是生物的进化极度缓慢的原因之一。一个已经成型的生物个体，是没办法进化的。
基因突变形成的新基因，会暂时存在于种群基因库中。基因决定生物的性状和生存能力。倘若环境改变，适应环境的生物存活，继续繁衍，并将优秀基因传递给自己的后代。不适应环境则死亡，其携带的基因也跟着消失。经过无数次环境的选择后，只会存在携带着适应环境的基因的生物个体。
以人类的祖先古猿为例。其在迭代的时候产生无数新的基因。而人类获得的那种，足以使人的智力大幅提升，在各种险恶环境下存活。同时，同样作为古猿的后代的猩猩，它们则有相当强的力量，基本是无天敌的存在。猴子最多是和古猿有着共同的祖先，也就是和人类有着共同的祖先。
现在回答第一个问题，人从来就不是由猴子进化来的，只是有共同的祖先。猿和猴并不是同一物种，只是外形相似。猿没有尾巴。
第二种质疑，那就要说说进化的目的，其并不是一定要往智慧方向进化，而是为了种族存活下去。而存活的手段，并不只有智慧。其次，进化始于基因突变，而基因突变是随机的、低频的。获得智慧并不是必然，而是一场意外。如果有其他的生命像人类一样幸运，获得这种使智力提升的基因，那么它们也可以进化成智慧生命。也就是说，这里面存在一个概率的问题。其他生命也有概率进化成智慧生命，只是这种概率极低。最后，就是竞争生存空间，在现代智人的发展过程中，有相当多的其他人种被现代智人屠杀至灭绝，这一点可以参考殖民时代发生的种种。
第三个疑问，则要引入“点断平衡理论”。该理论是进化论的一个重要补充，其主要观点是：进化的速度并不是匀速的，而是在某一种环境刺激下出现阶跃式变化，直到达到新的平衡。也就是环境影响进化的速度。而环境的变化同样是随机的，没有规律，不可预测的。
简单来说，从古猿进化到人类这个过程中，存在无数的“过渡物种”，而这些过渡物种在历史上存在的时间并不是一致。假如一过渡物种存在了三百万年，另外一过渡物种只存在了一百万年，那么找到前者的化石的概率就是后者的三倍！如果这个时间再继续缩短，那么，找到该物种的化石的概率，就会无限接近于零。
所以，这同样是一个概率的问题。至于由“化石断层”而引发的“外星物种起源论”，则是完全不靠谱的说法。
如果人类真的起源于外星，并在地球上安家的时候杀掉了地球上的土著，那么就会存在一个相当大的问题：人类既然从更高级的文明而来？是否也应该把那个文明的科技带来？其科技既然能使人类从其他星球到达地球，那现在为何不能挣脱地球到达其他星球？此外，既是其他文明而来，自然会有文字以记录历史，那为何人类几千年的文明中，没有类似的记录？
总之，现在的进化论已不单单只是最初达尔文总结出来的结论，它已经发展成了一个体系！倘若进化论是假的，那么与之相关联的基因学遗传学也就全部是假的，再进一步，所有的遗传育种与转基因生物也就全部是假的。
很多时候，往往会把进化论和生物的自适应搞混。进化是漫长的，必须要产生新的基因，且基因的突变不是以适应环境为目的，其突变是随机不受控制的，而自适应只是基因的选择性表达，并未产生新的基因。比如，人的皮肤会在紫外线的照射下变黑，这是基因的选择性表达，不是进化，如果因为紫外线而发生基因突变，并把这种突变遗传给下一代，才能称为进化。
而实际上，转基因作物已经进入了大众的生活。人类，不过是利用技术手段除去基因突变的随机性，把需要几百万年才能完成的进化压缩到了几十年。从现代综合进化论的角度来看，进化论根本就没那么玄奥和复杂。