选择一夜线后，时雨反驳了千夜选择的一夜的研究所，而提出去另一所。千夜线中路上千夜回忆了过去烧研究所，也是解释了为什么1作里千夜这么害怕老鼠，因为这让她想起了心理阴影。而一夜线则在最后补充的是一夜的回忆——她(榧夜)与原本的时雨的故事。
一夜线和千夜线的战斗是类似的，但一夜线的时雨决心相信一夜，并看破了一夜准备把收集的生命交给时雨的想法。事实上，千夜线最后也揭露了这一事实，说过1作最后的合同的内容。然后开始了一夜的回忆。最后，一夜消失了，留给时雨崭新的身体(和一夜线结尾一样)和一首她那个年代的流行音乐。
最后，一夜离去后，千夜学姐失去了那看透人心的能力，似乎代表着千夜能够开始信任他人。
一夜线是TE，在ED之后，我们获得了比千夜线和其他线更多的信息。千夜和一夜在去研究所之前的故事是一样的。当时千夜炸碎了那由多，并在千夜线之后没有提及，我当时以为那由多这个身份神秘的角色就这样断了联系，即使前面已经有剧情说她非正常人类。但ED后在学校被淹的水边，我们又看到了换了发饰的那由多。在这里，提到了那由多一直在打倒怪物，以及那由多似乎是一个可以相互共享记忆的群体，所以死一个其他人也会补充上来。

("复活"的那由多)
关于2作中那由多的行动，最开始时雨和千夜都感受到自己突然被塞进了另一个世界，虽然脑中有原本的记忆，但记忆却感觉不自然，而1作中的故事大纲虽然还保留着，但像小夜美被调离到其他班，那由多变成时雨的后桌这种细节却不一样。一夜推测是那由多的手段，但这实际情况是什么呢？
3作中我们得知，一夜制作怪物的手段传承自椿妃为代表的日本帝国研究机构的遗留技术，并做了些改进，甚至一夜的人偶中有不少能表现为正常的人，除了没有灵魂。这一点在2作中，时雨发现教室里除了时雨和那由多外其他人都是人偶后，交谈中我们可以得知。
我们知道陪伴昏迷的忧姬和与千夜殉情的选项，会影响那由多的后续行动。如果与千夜殉情，那么后面那由多就会发一大堆短信，告诉时雨自己准备了炸弹要炸毁全城，要求时雨去找到她。而选择陪忧姬，那么千夜就会来探病，期间可能那由多通过多个个体之一监视着时雨，被触动后自己放弃了原本的大爆炸计划，后面与时雨在学校见面，后面还来探病。后面面对恶魔诱惑，坚定选择自己就忧姬的话，有一段工厂爆炸的剧情，我个人认为是和千夜线中那由多对时雨的陷阱对应。

(千夜线中，那由多的陷阱)

(忧姬线中，疑似对应的剧情。可能那由多知道时雨忙着救自己的妹妹，便收敛了些)
值得注意的是，在前面时雨冲去和那由多对决时，千夜在电话中让时雨转告，提到那由多似乎和日本±有关。毕竟系列里发生了这么多事情，±自然会想办法调查。

(只提及过2句的，那由多的±背景之一)
那由多线(忧姬线BE)的最后，那由多那句话，结合前面和其他线的剧情，似乎暗示了那由多的过去——那由多曾经有姐姐，时雨像那由多的初恋，那由多有很多个，那由多的身体并非正常人类，那由多曾经的亲朋好友都走了只剩她一个，那由多现在为±工作。不过后面没有细说那由多的事情，谜团还是没有得到解答，甚至3作里也没解答。
关于时雨的内容，我还有一个未证实的想法。1作是单线叙事，而2作虽然是多线，但要通完其他3条线(包括一个明显的BE)后才能解锁。1作中时雨能够回溯避开BE，而02中则解释为是一夜代劳，时雨能做的，似乎只有加速自己的时间，产生高反应速度。
时雨真的不能自己选择回溯吗？我猜想，2作的不同结局或许也是时雨回溯过——出于对那由多的粉碎，对一夜认知的失去，对全员死亡的遗憾等等，并在这个过程中通过一夜给出过的各种方式的试炼，认识到一夜的真实想法，于是才解锁了一夜线。但这个我不好说是不是成立的。

然后是关于3作的内容。由于3作存档只有20个，剧情也不能往前跳转，我不方便回顾，就不总结全部的剧情了。千夜在2作的一夜线最后，被椿妃附身了。椿妃是一个被镇压的幽灵(类似一夜？)。在2作一夜线中间，千夜炸水库的时候，祠堂的封印被冲掉，于是椿妃获得自由。
2作在1作的基础上加入了那由多这一角色，而3作加入了求闻特。根据剧情，时雨的前世是瑞光。千夜和一夜……千夜的前世是椿妃，椿妃和九手是同一个实验产物的两面。百舌鸟从性格上像是小夜美的前世，虽然发色更像忧姬。镜花似乎是忧姬的前世，虽然发色更像小夜美。椿妃在家中是瑞光的妹妹，而镜花后来也以妹妹自居。
我不清楚的是，椿妃在剧情中一直没有离开现世(可能一直被封印着)，那作为转世的千夜怎么来的呢？椿妃和九手如果是一个人的两面的话，那椿妃和九手的转世是同一人还是什么？
然后在Hubris塔上，似乎说死在塔里的灵魂无法转世，但百舌鸟和镜花都和基友死在了塔里。基友和哈拉登的转世在前两作里没出场，但百舌鸟和镜花死在塔里后，按理说灵魂受困，和椿妃一样。结果3人都有转世。
类似的，时雨和羽由纪先后死了，之后又作为人偶行动，并经过调教逐步变成了现在的样子。他们的灵魂是否和原本的一样？
2作忧姬线里出现过神秘老人，似乎是3作中给瑞光看家的人。老人提到椿妃失踪时，瑞光应当在小牧。我查了一下，小牧市在爱知县，而塔在东京，这和3作剧情是冲突的——椿妃在塔上变成了怪物(从立绘上看，与后面对比，大概是被蓝蔷薇/求闻特上身了)，而瑞光则在塔上阻止她，想要破坏塔。最后，在椿妃“死”掉后，只剩下瑞光活着。

(老人提及椿妃的后续。椿妃和瑞光在塔上决战，但后续并未在作中直接提及。)

(老人似乎是为鹿仓家看家的)
这个老人是谁呢？我想了想作品里出现的任务，似乎活着的只有乡谷昴(基友的弟弟)。但我印象中没找到3作中对应的情节，只知道他是给瑞光修飞机的，和镜花合作过。

(老人最后怎么样了？)
求闻特和那由多一样，突然出现最后消失。最后似乎时雨以前还和求闻特有过交集，也是一堆谜团。

(疑似曾经时雨和求闻特的故事)
最后时雨拒绝了求闻特的眼珠，其是千夜学姐从1作就开始找的红皮魔道书。但是1作2线中，千夜以失去一个肾的代价抢到了戒指形态的红皮书，发现他是假的。不知道2作及之后的千夜的肾有没有因为时雨的回溯而避免被失去。2作中我们知道那些戒指都是假的。结果3作出现红戒指的时候，最开始我又乱了——到底存不存在啊？
和2作最后的千夜一样，时雨拒绝眼珠后，也再也看不到人偶鬼怪了……？总不能说都是幻想吧，人偶造成的事情都是实际发生的，是确定存在的事物。

(我们知道一夜只是真时雨对榧夜的称呼，有效时间只有榧夜人生的最后一点点时光。后面我们知道忧姬的要只是安慰剂，这里大概是给那段剧情的伏笔)
最后是关于音乐。2作继承了1作大量的音乐，有不少是我喜欢的。但2作遗憾的是，没有1作里我喜欢的那首千夜学姐的天台曲。但多了那由多的角色曲。
然后3作基本没有前两作的音乐，只有一首听着是1作封面曲的变奏。感觉比较可惜。

3作接续的是重制版12的剧情，而重置12相较于旧版有改动

lz分析的很细我玩下去都没有这么深入的思考只是觉得这个故事非常有意思