在Western Blot过程中，分子量Marker就像个标尺，可以帮助我们确定目标蛋白的分子量大小，判断蛋白是否成功分离，以及评估转移效率等。通过与蛋白 Marker 的迁移率进行比较，我们可以判断待测蛋白质的分子量范围，并评估电泳结果的准确性和可靠性。
此外，了解蛋白 Marker 的特点和使用方法对于实验的成功至关重要。选择合适的蛋白 Marker、正确使用和解读结果都需要一定的知识和经验。
蛋白Marker的分类
总体来说，目前最常用的蛋白Marker分为非预染蛋白Marker和预染蛋白Marker。
非预染蛋白Marker
非预染蛋白Marker是几种已知分子量并纯化好的蛋白质预混液，方便不同大小的蛋白比较。其条带在结合染料时，分子量不会改变，可准确评估SDS-PAGE的蛋白样品分子量。
非预染蛋白Marker在电泳过程中看不到，电泳结束后经过蛋白染色后才能起指示作用，无法在实验过程中起预示参照作用，属于“后知后觉”型的。预染蛋白Marker则可以在电泳时、电泳后，以及转膜后监测电泳情况和估计迁移率，预染蛋白Marker的出现方便了实验人员的操作。
预染蛋白Marker
预染蛋白 Marker 就像是一位贴心的向导，为我们的实验之旅点亮了明灯😄 它在生产时就结合了染料，所以不同分子量的条带会呈现出不同颜色，让我们在电泳过程中就能轻松识别。
使用预染蛋白 Marker 有很多好处呢！它可以帮助我们实时监控电泳进程，快速判断蛋白的大小和位置，还能方便地评估样品的电泳效果。而且，它的颜色鲜艳，让结果一目了然，就像彩虹一样美丽🌈
预染蛋白Marker与染料共价耦联，所以在不同的缓冲条件下电泳时迁移特性可能会发生某些变化，可能导致一些偏差，有时候Marker的条带未必能和我们的目标蛋白完全一样，我们得到的也不过是一种相对Marker指示的参考大小哦。
蛋白Marker按分子量范围又分为高分子量、低分子量、宽分子量几类。检测大分子量蛋白经常使用到高分子量范围Marker，检测小蛋白甚至是一些多肽常会用到小分子量范围Marker。
marker一定要都跑出来吗？
Marker 并不一定要都跑出来，它的作用主要是作为参考，帮助我们确定目标蛋白的大小和位置。
在电泳实验中，Marker 通常包含一系列不同分子量的蛋白质标准品，它们会在凝胶中形成一系列可见的条带。然而，有时由于实验条件、样品性质或其他因素的影响，Marker 中的某些条带可能无法清晰地显示出来。
如果大部分 Marker 条带都能正常跑出，我们可以根据可见的条带进行分子量的估计和比对。