1983年4月初，柳州市河沙公司的职工黄健忠将自己十多天前在柳江中捞沙作业时捕捞到一个铜印送给了柳州博物馆，经过专家考证证实，这方铜印是南明王朝廉州知府的官印，这方铜印印面是阳刻的“廉州府印”四个篆字，铜印通高9.9厘米，印面纵横8.8厘米，印钮高9厘米，铜印背面尚可辩认出“永历六年九月”的楷书款识。永历六年是1652年，也即是清顺治九年，是南明王朝建立的第七个年头，永历是南明王朝的第二个年号。“廉州府印”为什么会失落在柳江河中呢？
查史料得知，顺治四年（16476年，南明永历元年正月初一），南明永历帝刚到达梧州，正月十六日清军李成栋部攻陷肇庆，南明两广总督弃城逃跑，永历帝率众奔走到平乐后，于二十一日抵达桂林。二十三日，清军李成栋部又攻下高州、雷州、廉州，廉州为清军占领。七月初一，南明镇国将军朱统鉴率军围攻廉州城，至十月十五日攻下了廉州城。此后，廉州在南明军队和清王朝军队的争夺中，一会儿属于南明王朝所有，一会儿又属于清王朝占领，直到顺治九年（1652年，南明永历六年），清军耿继茂军队现度攻占廉州城，南明巡按高、雷、廉、琼四府俭都御史张孝起被俘，绝食而死。但不久，廉州又被南明王朝的军队占领。到了顺治十年（1653年，南明永历七年年）二月，清军再占廉州，南明道员战死，周腾凤、曾仲宏、董履全等一批南明官员被捕后斩首，顺治十一年（1654年，南明朝永历八年）四月，南明西宁王李定国从柳州进发，攻入廉州城，并准备与郑成功部会师。十月二十九日，郑成功派出的五镇官兵分乘百艘战船从台湾前往廉州途中，因风向海流不合，无法到达，十一月十八日，清军靖南将军与尚可喜会师合兵，攻占廉州，至此廉州由清军控制，以上史述均见（唐志敬《清代广西历史纪事》）。
从以上史述中可知，清军与南明军队反复争夺廉州的战事，都是沿着南流江到柳州这一战线进行的。其中在两次大的战役中，南明王朝的廉州府官员几遭全军覆没。当时在廉州至柳州的战线中，南明王朝有两个重要的将领，一是南明宗室镇国将军朱统鉴，他率领的军队坚守在廉州一带与清军抗衡。顺治十一年，南明王朝军队集中力量攻打柳州、梧州时，清军趁机围攻廉州、灵山等地，据守灵山的朱统鉴被清军擒杀，廉州千岁庙就是为纪念朱统鉴而建的。一是南明西宁王李定国，他是南明王朝中最重要的依靠力量，他率军队在廉州至柳州战线上反复冲杀，多次进出廉州和柳州，挽两城之危难。这枚永历六年的“廉州府印”就是在频繁的战乱中，随官员撤退而失落在柳江，至于具体是哪一年，哪一次战事中失落柳江有待进一步查证考究，但“廉州府印”在柳江中发现，可以证实当时廉州至柳州之间是南明王朝军队与清王朝军队争夺最激烈的地带之一。由此也见证了以合浦为始发港的海上丝绸之路依托南流江水运的优势，在明未清初之间，还成为南明王朝军队和清王朝军队在广西开展争夺战的重要战线。南明“廉州府印”的出土就是最有力的物证之一。
查合浦史料得知，千岁庙为纪念南朝宗室镇国将军朱统鉴所建，而朱统鉴当年确是以廉州为基地，带领军队与清朝军队前后争战了八年，顺治十一年，与前来征剿的清朝靖南王耿继茂和平南王尚可喜的军队激战，战死于灵山，时灵山为廉州府辖地。朱统鉴战死后，结束了廉州府属南明王朝辖地的历史。
当年，清朝廷设廉州总兵官（正二品官秩）。此后，廉州成了清朝廷与南明王朝郑成功部争夺的拉锯战地带，廉州府时属南明军队占据，时属清廷军队占据，战乱不断。清廷为了对付郑成功部队，采取严厉的“海禁”，沿海居民内徙50里，严禁出入。康熙十二年（1673年）十一月，吴三桂反清，吴三桂的部队攻占了廉州城，俘虏知府徐化民，合浦知县金世爵战死。廉州又成了清廷军队和吴三桂争夺的拉锯战地带，而郑成功的军队又不时的围攻廉州，此种战乱状态直至康熙十七年（1678年）八月吴三桂死，康熙二十二年（1683年）十月，郑成功孙投降清廷才结束。廉州府此时才真正归属清朝。了解这段历史很重要。在朱统鉴战死后至廉州府在最后真正归属清朝之前的30年间，也就是清朝立国的40年间，廉州府都是以明朝遗民遗地与清朝军队抗争的，这就为朱统鉴之享千岁庙祭祀埋下了伏笔。祭祀朱统鉴，实际上祭祀一个王朝的消失，千岁庙正是这种遗民情结寄托的产物。
1644年农历4月29日（农历），李自成在北京称帝，五月十五日（农历）明福王在南京即帝位，是为弘光帝，十一月初一，清帝福临在北京即位。仍用大清国号顺治纪元。廉州属南明王朝辖地。顺治四年（1647年）正月，清军李成栋围攻廉州，三月攻占廉州，七月初一，南明镇国将军朱统鉴，率领军队围攻廉州，与清朝军队开展了为期三个多月的拉锯战，最后于十月十五日（农历）攻下了廉州府。朱统鉴攻下廉州后，对巩固南明王朝产生了巨大的影响，第二年，清两广总督佟养甲叛清投明，南明永历帝抵南宁，设行在于全州。时梧州、柳州、桂林尽归南明所有。顺治七年（1650年），郑成功部队又从海路攻占钦州龙门岛（时属廉州府辖），桂、粤、闽、台、琼连接成片，南明王朝呈现一片生机。但此时，南明王朝内部产生权力争斗，清军趁机反攻。相继占领了广州、桂林、梧州，顺治九年（1652年）又攻占了廉州，朱统鉴率军与清平南耿继茂部激战后夺回廉州。顺治十年（1653年）二月，耿继茂部联合其它军队再次占领了廉州城，朱统鉴部退守灵山（时属廉州府辖）。在清军与南明军队的争战中，朱统鉴所部无疑是一支战斗力最强抵抗力量。为了拔去这颗肉中刺，顺治十一年（1654年）清平南王尚可喜、靖南王耿继茂联合起来围攻灵山时，南明军队主力正在攻打梧州、新会，朱统鉴成孤军之势。于同年六月战死灵山。朱统鉴战死后，跟随朱统鉴征战的珠乡子弟兵偷偷把朱统鉴的灵位带回廉州，于是就有了合浦千岁庙，为后世见证了当年南明王朝与清王朝以廉州为据点，在南流江流域开展的政权争战遗梦。