南安市境内有珍稀名贵树种,如楠木、檫树、花梠木、红豆杉,以及水杉、银杏等;竹类以长枝竹、青皮竹等为大宗;珍贵药材有茯苓、黄柏、肉桂、金边地鳖、穿山甲、小海马等6种。农、牧、茶、果品种资源丰富,其中闽南黄牛、吐绶鸡闻名全区。全市有42种果树种类,热带、亚热带果树有龙眼、荔枝、柑橘、香蕉等名果。茶树在本市发现与种植始于晋代丰州莲花峰,石亭绿是福建历史名茶。动物有云豹、虎、山獐、小灵猫、刺猬、豪猪等35种;鸟类有鹧鸪、斑鸠、雉鸡、白颈长尾雉鸡、猫头鹰等86种;爬行类有眼镜王蛇、金环蛇、银环蛇、赤链蛇、龟壳花蛇、绿毛龟等29种;两栖类有蛙、蟾蜍等11种。其中属于国家保护的野生动物,一级的有云豹、白颈长尾雉,二级的有穿山甲、虎纹蛙、水獭、蟒蛇、小灵猫等。水产资源有185个品种,其中较有经济价值的有英氏鲻、鲻鱼等4种,日本对虾、长毛虾、斑节对虾等11种,以及石斑鱼、河鳗等;大小伯、内盘、奎霞一带海域不仅是鲻鱼产卵场所,同时发现有江珠贝、贻贝、西施舌、海胆、石花菜等海珍品在这一带繁生。养蜂业在全省占有重要位置