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DNA提取需要知道的那些事

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1.处理材料
a.如提取材料为血液,可直接使用200μl新鲜、冷冻或加入各种抗凝剂的血液,不足200μl可加缓冲液GA补足;
注意:
如需处理更大体积血液,如300μl-1ml,应按以下步骤操作:在样品中加入3倍体积红细胞裂解液(例如,300μl血液加入900μl红细胞裂解液),颠倒混匀,室温放置5min,期间再颠倒混匀几次。10000rpm(~11,500×g)离心1min(若离心机最高转速不允许,可3000rpm(~3,400×g)离心5min),吸去上清,留下白细胞沉淀,加200μl缓冲液GA,振荡至彻底混匀。
b.如果处理血样为禽类、鸟类、两栖类或更低级生物的抗凝血液,其红细胞为有核细胞,因此处理量5-20μl,可加缓冲液GA补足200μl后进行下面的裂解步骤。
c.贴壁培养的细胞应先处理为细胞悬液,然后10,000rpm(~11,200×g)离心1min,倒尽上清,加200μl缓冲液GA,振荡至彻底悬浮;
d.动物组织(脾组织用量应少10mg)应先打碎处理为细胞悬液,然后10,000rpm(~11,200×g)离心1min,倒尽上清,加200μl缓冲液GA,振荡至彻底悬浮。
注意:
如果需要去除RNA,可加入4μlRNaseA(100mg/ml)溶液(客户自备,目录号:RT405-12),振荡15sec,室温放置5min。
2.加入20μlProteinaseK溶液,混匀。
a.提取血液基因组时,只需加入ProteinaseK混匀,即可继续进行下一步。
b.提取细胞基因组时,只需加入ProteinaseK混匀,即可继续进行下一步。
c.提取组织基因组时,加入ProteinaseK混匀后,在56℃放置,直至组织溶解,
简短离心以去除管盖内壁的水珠,再进行下一步骤。
注意:
不同组织裂解时间不同,通常需1-3h即可完成(鼠尾需要消化过夜)。不会影响后续操作。每小时颠倒混合样品2-3次,用水浴振荡器也可。
3.加入200μl缓冲液GB,充分颠倒混匀,70℃放置10min,溶液应变清亮,简短离心以去除管盖内壁的水珠。
注意:
加入缓冲液GB时可能会产生白色沉淀,一般70℃放置时会消失,不会影响后续实验。如溶液未变清亮,说明细胞裂解不彻底,可能导致提取DNA量少和提取出的DNA不纯。当血液体积≤200μl且没有采用红细胞裂解处理,或是样本储存条件不佳,水浴后颜色可能为深褐色,注意溶液中没有团块等沉淀。
4.加人200μl无水乙醇,充分振荡混匀15sec,此时可能会出现絮状沉淀,简短离心以去除管盖内壁的水珠。
5.将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中),12,000rpm(~13,400×g)离心30sec,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
6.向吸附柱CB3中加入500μl缓冲液GD(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm(~13,400×g)离心30sec,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
7.向吸附柱CB3中加入600μl漂洗液PW(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm(~13,400×g)离心30sec,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
8.重复操作步骤7。
9.将吸附柱CB3放回收集管中,12,000rpm(~13,400×g)离心2min,倒掉废液,将吸附柱CB3置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
注意:
这一步的目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,漂洗液中乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。
10.将吸附柱CB3转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50-200μl洗脱缓冲液TE,室温放置2-5min,12,000rpm(~13,400×g)离心2min,将溶液收集到离心管中。
注意:
洗脱缓冲液体积不应少于50μl,体积过小影响回收效率。洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用ddH2O做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率;且DNA产物应保存在-20℃,以防DNA降解。为增加基因组DNA的得率,可将离心得到的溶液再加入吸附柱CB3中,室温放置2min,12,000rpm(~13,400×g)离心2min。


IP属地:河北1楼2024-05-22 17:02回复