软件著作权在认定高新技术企业中的重要用途主要体现在以下三点：
1. 技术创新的证明：软件著作权是企业自主研发的技术成果的法律证明，能够有效证明企业具备创新能力。拥有软件著作权的企业，往往能够在技术上与同行竞争，符合高新技术企业的创新要求。
2. 加分项：在高新技术企业认定过程中，软件著作权可以作为评审指标之一，提升企业的综合评分，增加通过认定的可能性。特别是当企业的核心技术依赖于软件开发时，著作权的拥有会直接影响认定结果。
3. 增强企业核心竞争力：通过软件著作权的保护，企业能够维护其独立研发成果，防止技术泄露和侵权行为，增强企业的市场竞争力。这对于高新技术企业的长期发展至关重要。
总的来说，软件著作权在认定高新技术企业过程中起到了技术创新、加分和竞争力提升的重要作用。