软件著作权在高新技术企业认定中有以下重要用途：
满足认定条件：高新技术企业认定要求企业拥有一定数量的自主知识产权，软件著作权是被认可的知识产权形式之一。
证明研发能力：软件著作权能够体现企业的自主研发能力和创新水平，是企业技术实力的重要证明，有助于提升企业在高企认定中的评分。
支撑科技成果转化：软件著作权可以作为企业科技成果的重要支撑，展示企业的科技成果转化能力和创新成果，进一步增强企业在高新技术领域的认可度。