IBD 的诊断：粪便和血液检查、内镜检查并进行组织活检。为诊断炎症性肠病，医生必须首先排除其他可能的发炎原因。例如，寄生虫或细菌感染可产生炎症。因此，医生会做几项检查。分析大便样本，明确有无细菌或寄生虫感染（例如在旅途中感染），包括抗生素用药引起的一种细菌感染（艰难梭菌感染[旧称难辨梭菌感染]）。可能还会检査直肠有无性传播感染，例如 淋病、 疱疹病毒感染和 衣原体感染。
在内镜检查（使用观察管检查消化道）时，可从消化道内壁采集组织样本，并在显微镜下寻找结肠炎症（结肠炎）或小肠末段（回肠）炎症其他病因的证据。上述切取并检查组织样本的操作称为活检。医生还需考虑引起类似腹部症状的其他疾病，比如 肠易激综合征、 缺血性结肠病（多见于 50 岁以上人群）、 营养吸收不良综合征（包括 乳糜泻）以及一些妇科疾病。为了排除其他疾病，医生可能会做影像学检查，例如腹部 X 射线检查、 计算机断层扫描(CT) 或 磁共振成像(MRI)。医生可能会做 视频胶囊内镜检查，以评估有症状提示患有克罗恩病者的肠道。
IBD 的治疗：药品、有时需要进行手术、饮食和压力管理。虽然 IBD 无法治愈，但包括氨基水杨酸盐、皮质类固醇、免疫调节药、生物制剂和抗生素在内的许多药物都有助于减轻炎症并缓解 IBD 的症状。病情非常严重者有时需要手术。
饮食和压力管理：大部分患者及其家人对饮食和压力管理感兴趣。虽然一些患者声称某些饮食可以帮助改善炎症性肠病（包括严格限制碳水化合物的饮食），但这些饮食的有效性尚未在临床试验中得到证实。有时，医生建议压力管理技巧，帮助患者处理慢性疾病带来的压力。
保持健康：由于炎症性肠病患者存在基础疾病、营养不良或使用免疫调节药，因此他们出现某些感染和疾病的危险更大。接种疫苗并接受诊断性检查和筛查有助于降低此类危险。
流感疫苗可帮助预防流感，需每年接种。 肺炎球菌疫苗有助于预防肺炎链球菌引起的细菌感染。50 岁及以上人群应接种 带状疱疹疫苗。50 岁以下的 IBD 患者在接种该疫苗之前，应先咨询医生是否需要接种。带状疱疹疫苗应尽可能在患者开始服用免疫调节药之前接种。患者还应视情况常规接种 破伤风-白喉疫苗、 甲型肝炎疫苗、 乙型肝炎疫苗和 人乳头瘤病毒疫苗。建议炎症性肠病患者（包括正在服用免疫调节药的患者）接种采用 mRNA 技术的 COVID-19 疫苗，例如辉瑞-拜恩泰科和莫德纳生产的疫苗。
患有炎症性肠病且未服用免疫调节药的女性患者应每三年接受一次基于 巴氏涂片检查的宫颈癌筛查。患有炎症性肠病且正在服用免疫调节药的女性患者应每年接受一次巴氏涂片检查。患有炎症性肠病且正在服用或计划服用免疫调节药或生物制剂的患者应当每年接受 皮肤癌筛查，并使用 防晒霜、穿着 防护服。有骨密度降低（骨质疏松症）风险的人应当接受 双能 X 射线吸收测定 (DXA) 扫描。
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