俗话说，“物极必反”，经历了中世纪基督教的绝对统治，近代的欧洲掀起了反宗教的滚滚洪流。一波又一波，直至今日。
文艺复兴时期的人文主义者，就已经开始强调人的价值、贬低神的地位，反对禁欲主义（有相当的合理性），但他们还不敢公然反对基督教。
16至17世纪，布鲁诺、斯宾诺莎等人的泛神论在欧洲开始广泛流行，并开始对圣经进行研究批判。这其实是一种从有神论向无神论过渡的隐秘形式，到了托马斯.霍布斯，别人已经开始把他称为无神论者（因为他否定非物质的精神实体的存在）。
17-18世纪在欧洲又兴起了自然神论，许多人反对 “天启”宗教，提倡理性宗教。“他们一般也承认上帝存在和上帝创世说，但主张上帝创世之后就让世界按照合乎理性的自然规律自己运转而不再干预。”
18世纪法国的思想家（像拉美特里、狄德罗、爱尔维修、霍尔巴赫等），开始对传统宗教和教会统治公开反叛，彻底地否定神的存在和灵魂不朽，鼓吹唯物主义和无神论。
19世纪的德国古典哲学家，则以理性的名义宣传更加彻底，“有根有据”的无神论，康德就是始作俑者。邓晓芒在《西方哲学史》中说，“康德成年以后从未进过教堂，骨子里并不相信上帝，而是力图把宗教道德化。”